En 2019, Toon Clynhens termine notamment huitième du Tour des Flandres juniors (moins de 19 ans)[1],[2]. Il est également sélectionné à plusieurs reprises en équipe nationale de Belgique. L'année suivante, il rejoint l'équipe EFC-L&R-Vulsteke pour ses débuts espoirs (moins de 23 ans)[2]. Il ne délaisse pas pour autant sa scolarité en poursuivant des études d'ingénieur à la KU Leuven[3].
Lors de la saison 2021, il devient un membre régulier de l'équipe de Belgique espoirs. Il se révèle au mois de juin en terminant troisième de la Course de la Paix-Grand Prix Jeseníky, une manche de la Coupe des Nations Espoirs, où il montre ses qualités de grimpeur[4]. Le mois suivant, il finit cinquième du Tour du Piémont pyrénéen en France. Il est cependant brisé dans son élan par une chute sur la première étape du Tour de la Vallée d'Aoste. Victime d'une fracture de la clavicule, il est écarté des compétitions pendant plusieurs semaines[5]. Il conclut néanmoins sa saison par une septième place sur le Tour de Lombardie amateurs.